O IPQ, enquanto Instituição Nacional de Metrologia, tem como missão garantir o rigor e a exatidão das medições realizadas, assegurando a sua comparabilidade e a rastreabilidade, a nível nacional e internacional, e a realização, a manutenção e o desenvolvimento dos padrões nacionais das unidades de medida nos domínios do Metrologia Científica, Metrologia Aplicada e Metrologia Legal, concretizando o objetivo Constitucional da soberania dos Padrões Nacionais das unidades de medida e do Controlo Metrológico dos instrumentos de medição, necessários à indústria e à sociedade portuguesa em geral.

Pretende ser o suporte da competitividade nacional, contribuindo para o bem-estar dos cidadãos através de uma infraestrutura metrológica tecnologicamente avançada e ser uma referência nacional na rede metrológica europeia em desenvolvimentos, contribuindo para a liderança da Europa no quadro da economia mundial.